Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc115Q8VE99 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc115Q8VE99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc115Q8VE99 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc115Q8VE99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc115Q8VE99 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc115Q8VE99 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms