Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU1

Rhov, Rho-related GTP-binding protein RhoV, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhovQ8VDU1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RhovQ8VDU1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RhovQ8VDU1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RhovQ8VDU1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms