Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nae1Q8VBW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nae1Q8VBW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nae1Q8VBW6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nae1Q8VBW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms