Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SdsQ8VBT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SdsQ8VBT2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SdsQ8VBT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SdsQ8VBT2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms