Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r200Q8R281 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r200Q8R281 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r200Q8R281 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r200Q8R281 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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