Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Impg1Q8R1W8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Impg1Q8R1W8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Impg1Q8R1W8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Impg1Q8R1W8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Impg1Q8R1W8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Impg1Q8R1W8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Impg1Q8R1W8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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