Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf183Q8QZS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rnf183Q8QZS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rnf183Q8QZS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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