Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf183Q8QZS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf183Q8QZS5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf183Q8QZS5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms