Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Treml1Q8K558 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Treml1Q8K558 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Treml1Q8K558 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms