Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Hecw1Q8K4P8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Hecw1Q8K4P8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Hecw1Q8K4P8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Hecw1Q8K4P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Hecw1Q8K4P8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.3 ms