Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PolbQ8K409 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PolbQ8K409 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PolbQ8K409 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms