Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MyripQ8K3I4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MyripQ8K3I4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MyripQ8K3I4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms