Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccm2Q8K2Y9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccm2Q8K2Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccm2Q8K2Y9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms