Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stn1Q8K2X3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stn1Q8K2X3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stn1Q8K2X3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stn1Q8K2X3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Stn1Q8K2X3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms