Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr1eQ8K202 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1eQ8K202 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Polr1eQ8K202 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms