Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek9Q8K1R7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek9Q8K1R7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek9Q8K1R7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek9Q8K1R7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
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