Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scamp1Q8K021 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scamp1Q8K021 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Scamp1Q8K021 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms