Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SbsnQ8CIT9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SbsnQ8CIT9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbsnQ8CIT9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbsnQ8CIT9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms