Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CopaQ8CIE6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CopaQ8CIE6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CopaQ8CIE6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CopaQ8CIE6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms