Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Polr2bQ8CFI7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Polr2bQ8CFI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Polr2bQ8CFI7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2bQ8CFI7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Polr2bQ8CFI7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Polr2bQ8CFI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms