Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc178Q8CDV0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc178Q8CDV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc178Q8CDV0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc178Q8CDV0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms