Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc73Q8CDM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc73Q8CDM4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc73Q8CDM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc73Q8CDM4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms