Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
E4f1Q8CCE9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
E4f1Q8CCE9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
E4f1Q8CCE9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
E4f1Q8CCE9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms