Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Vps53Q8CCB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps53Q8CCB4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Vps53Q8CCB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps53Q8CCB4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms