Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAL5

Gpc5, Glypican-5, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc5Q8CAL5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gpc5Q8CAL5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gpc5Q8CAL5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc5Q8CAL5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc5Q8CAL5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms