Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S4

Ccdc186, Coiled-coil domain-containing protein 186, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc186Q8C9S4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc186Q8C9S4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc186Q8C9S4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc186Q8C9S4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc186Q8C9S4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms