Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7U1

N4bp3, NEDD4-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp3Q8C7U1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4bp3Q8C7U1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
N4bp3Q8C7U1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
N4bp3Q8C7U1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
N4bp3Q8C7U1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms