Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp20Q8C6M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp20Q8C6M1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp20Q8C6M1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp20Q8C6M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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