Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4H2

Samd3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd3Q8C4H2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Samd3Q8C4H2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd3Q8C4H2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samd3Q8C4H2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samd3Q8C4H2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms