Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Csgalnact2Q8C1F4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csgalnact2Q8C1F4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csgalnact2Q8C1F4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms