Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp37Q8C0R0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp37Q8C0R0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp37Q8C0R0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp37Q8C0R0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms