Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Iffo1Q8BXL9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Iffo1Q8BXL9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Iffo1Q8BXL9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Iffo1Q8BXL9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms