Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Triml1Q8BVP1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Triml1Q8BVP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Triml1Q8BVP1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Triml1Q8BVP1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms