Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rccd1Q8BTU7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rccd1Q8BTU7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rccd1Q8BTU7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rccd1Q8BTU7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rccd1Q8BTU7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms