Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTF7

Lig4, DNA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig4Q8BTF7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lig4Q8BTF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lig4Q8BTF7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lig4Q8BTF7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms