Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU6

Gjc2, Gap junction gamma-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc2Q8BQU6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjc2Q8BQU6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gjc2Q8BQU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gjc2Q8BQU6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gjc2Q8BQU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms