Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abraxas1Q8BPZ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abraxas1Q8BPZ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abraxas1Q8BPZ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abraxas1Q8BPZ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms