Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sgsm1Q8BPQ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sgsm1Q8BPQ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sgsm1Q8BPQ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sgsm1Q8BPQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sgsm1Q8BPQ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms