Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tspan12Q8BKT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan12Q8BKT6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tspan12Q8BKT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tspan12Q8BKT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms