Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp1Q8BJQ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp1Q8BJQ2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp1Q8BJQ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp1Q8BJQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms