Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smarcal1Q8BJL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcal1Q8BJL0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms