Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vipas39Q8BGQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vipas39Q8BGQ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vipas39Q8BGQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vipas39Q8BGQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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