Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8BGN9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGN9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q8BGN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGN9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Q8BGN9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Q8BGN9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Q8BGN9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms