Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Best2Q8BGM5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Best2Q8BGM5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Best2Q8BGM5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms