Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1l4Q8BGJ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2af1l4Q8BGJ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
U2af1l4Q8BGJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
U2af1l4Q8BGJ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
U2af1l4Q8BGJ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms