Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pknox2Q8BG99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pknox2Q8BG99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pknox2Q8BG99 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pknox2Q8BG99 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms