Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srrm3Q80WV7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srrm3Q80WV7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srrm3Q80WV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srrm3Q80WV7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms