Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrrc1Q80VQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrrc1Q80VQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc1Q80VQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc1Q80VQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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