Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Otop3Q80UF9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Otop3Q80UF9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Otop3Q80UF9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms