Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NischQ80TM9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC47.43■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.43■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC47.38■■■■■ 5.18
NischQ80TM9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC47.35■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC47.34■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
NischQ80TM9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC47.28■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
NischQ80TM9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC47.24■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC47.23■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.22■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC47.21■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC47.2■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.15
NischQ80TM9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC47.18■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC47.16■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.14
NischQ80TM9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.11■■■■■ 5.13
NischQ80TM9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms