Protein–RNA interactions for Protein: Q80TF4

Klhl13, Kelch-like protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl13Q80TF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl13Q80TF4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl13Q80TF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl13Q80TF4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms